• 网络药理学与实验验证相结合探讨芎归散抗动脉粥样硬化作用机制

    分类: 医学、药学 >> 医学、药学其他学科 提交时间: 2022-11-02

    摘要:芎归散(QP)是中医药中的经典处方,在过去几十年中已显示出治疗动脉粥样硬化的潜力。然而,介导这些心血管益处的机制仍有待完全阐明。在这里,我们利用网络药理学方法和体外模型研究了QP对动脉粥样硬化的作用和机制。从公共数据库中收集QP的活性成分和相关靶点。通过广泛应用生物信息学方法,包括蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络、基因本体学(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG),确定了QP对抗AS的中枢靶点和信号通路。在LPS刺激的小鼠巨噬细胞RAW264.7中验证了预测的主要靶点。在该模型中还评估了QP的抗炎特性。通过对QP的电子调查,确定了18种活性成分和49种与AS相关基因交叉的化学靶点。KEGG途径分析显示这些化学靶点的脂质和动脉粥样硬化途径高度富集。生化分析显示,QP对预测的化学靶点(PPARr、CAT、PTGS2)和LPS诱导的炎症基因(IL1、IL6和TNFα)的表达有显著影响。这些抑制作用与LPS刺激激活的NF-κB信号通路的抑制有关。我们的发现揭示了QP在预防和治疗动脉粥样硬化方面的治疗潜力。

  • 二维光学刺激下的视觉感知定律

    分类: 计算机科学 >> 计算机应用技术 分类: 医学、药学 >> 医学、药学其他学科 分类: 工程与技术科学 >> 光学工程 提交时间: 2021-05-24

    摘要: 人类对刺激量的感知分为数量感知和质量感知。无论是韦伯-费克纳(Weber-Fechner)的对数感觉定律还是史蒂文斯(Stevens)的幂函数感觉定律,都是关于感觉量与一维亮度刺激之间定量关系的定律。图像属于具有二维亮度分布特征的刺激量。本文研究的是二维亮度刺激的质量的感知,即二维亮度刺激质量好坏程度的感知。好坏程度是一个模糊的心理学概念,因此我们需要用模糊数学的方法来量化图像视觉感知质量的好坏程度,即建立一个模糊隶属函数PQ来定量表示图像视觉质量的好与坏的程度。

  • 2019年新型冠状病毒导致的致命肺渗漏的病理生理学机制和防治策略

    分类: 医学、药学 >> 基础医学 分类: 医学、药学 >> 医学、药学其他学科 提交时间: 2020-02-25

    摘要:自2019年12月爆发以来,2019年新型冠状病毒已在全球造成2596人死亡,并且有超过11,000名患者仍处于严重状况。该病毒和由该病毒引起的医疗状况被命名为SARS-CoV-2和COVID-19。虽然已经广泛应用了抗病毒、对症和功能支持性疗法,每天仍有100多名患者死于该病毒感染。COVID-19最常见的致命并发症是急性呼吸窘迫综合征(ARDS)。SARS-CoV-2在世界范围内的大流行可能仍然存在。其它病毒感染引起的肺炎亦可导致ARDS,出现类似的危重情形,这些病毒包括如非典型的急性呼吸系统综合症(SARS)、中东呼吸综合征(MERS)和流感病毒引起的肺炎。因此,制定更有效的降低病毒所致的ARDS死亡率的策略,不但是当前抗新冠疫情的迫切需要,也是全球范围内降低病毒性肺炎死亡率的长期需要。ARDS曾被称为湿肺,血管泄漏导致的肺水肿是其最重要的病理特征之一,重型COVID-19的临床表现和胸部计算机断层扫描图像特征(白肺)符合ARDS。确定水肿液从何处及如何渗漏到肺部,是制定基于机制的预防和阻止水从肺毛细管向肺间质渗漏的策略,降低湿肺死亡率的关键。对于轻度和中度病例,非类固醇消炎药,如用于风湿性关节炎的药物,可能有助于防止和减少这种漏水。免疫抑制剂(如西罗莫司和巨蜥)可能使病毒感染、免疫反应和非免疫炎症造成的损伤高峰时间错开,从而降低肺漏水程度,防止危及生命情况出现。使用清火中草药可能也有抗炎用。对于严重病例,血液透析可能是消除大多数炎症介质和细胞毒性物质的有效策略。

  • 新冠肺炎(COVID-19)中药天然产物计算筛选与文献证据集成分析

    分类: 医学、药学 >> 医学、药学其他学科 提交时间: 2020-02-17

    摘要:药物重定位(老药新用)策略在新发传染病中具有独特应用前景。我们前期提出了一种新的药物重定位系统——aCODE,可以基于疾病流行早期有限信息对潜在有效的天然产物进行预测。本文基于计算工具与文献证据,对可能在新冠病毒肺炎(COVID-19)防治中发挥作用的中药天然产物进行理论研究,发现:(1)文献调研共发现56种经过实验验证具有抗冠状病毒活性的天然产物成分,可靶向冠状病毒的结构蛋白和非结构蛋白;(2)将aCODE系统所预测的抗冠状病毒天然产物成分与文献证据对比,发现交集有大黄素、甘草酸、人参皂苷R1、利血平和杨梅素等。大黄素可破坏冠状病毒S蛋白与宿主ACE2相互作用,阻止病毒入侵宿主细胞;同时具有抑制3a蛋白离子通道、阻止病毒释放的作用。甘草酸或其衍生物也是国内相关团队在新冠病毒肺炎治疗研究中重点关注的候选药物,已进入临床试验。(3)针对中药预测结果中大量出现的芳香化合物,aCODE系统增加芳香植物提取物数据源,计算发现氨基肉桂酸、肉桂醛、茴香烯、紫苏醇、芳樟醇、柠檬烯具有潜在的抗病毒效应。提示“芳香避秽”的细胞分子学机理值得进一步深入研究。

  • T-Area-Marker for Scientific Images

    分类: 医学、药学 >> 医学、药学其他学科 分类: 数学 >> 几何与拓扑 分类: 计算机科学 >> 计算机科学的集成理论 提交时间: 2018-03-31

    摘要:Labeled images are one of the most important means of scientific communication and education. However, traditional markers (arrows, lines) are point markers; do not include information about how large the feature is. We designed an efficient marker system for labeling scientific images (electron or light microscopy, CT, MRI, ultrasonography, camera pictures, etc), called the “T Area Marker, (TAM)”. The basic TAM marker looks like a “T”, composed of a line segment and a small tick on one end; it defines an imagined circle that stands on the tickless end and the diameter of the circle is equal to the length of the line segment. Thus the TAM can define an exact area rather than a single point; and the imagined circle does not break the continuity of the image (unlike traditional visible circles, rectangles, etc). A TAM with N ticks (N>1) means the diameter equals to N times the length of TAM. A TAM may also have a tail and/or several tail branches to define translation of the imagined circle, thus define complicated areas. tAreaMarker.py is free software that combines the drawing and reading of TAMs, although in most cases TAMs are easily interpreted without computer assistance.