二代测序技术在微生物和感染性疾病中的应用

分类： 医学、药学 >> 临床医学 提交时间： 2018-04-08 合作期刊: 《协和医学杂志》

黄晶晶 肖　盟 徐英春

摘要： 随着感染性疾病防治在卫生保健方面的重要性日益凸显，传染性疾病引起的社会关注逐渐增多，新技术在人类预防和控制病原体传播方面发挥着巨大作用。微生物实验室作为病原体检测的一线科室，通过镜检、培养、鉴定、药敏等方法，在感染控制中发挥着重要作用。传统的分子诊断和基因分型方法提供的信息有限，通常不能满足疫情爆发和传播调查需求。二代测序（next generation sequencing，NGS）在单次序列测定中可确定菌株基因组完整的DNA序列，并从这些数据中得到抗生素抗性、毒力及分型等可用于疫情调查的信息，进一步用于开展疫情特异性筛查。本文概述NGS技术及其在医院感染性疾病爆发调查、未知病原体鉴定、毒力分析、耐药基因组研究等临床微生物领域中的应用。

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