分类: 生物学 >> 植物学 提交时间: 2022-11-24 合作期刊: 《广西植物》
摘要: 云南樱花品种红霞(Hongxia)广泛种植于滇中地区,3 月开花,半重瓣至 重瓣,粉红色,观赏价值极高。红霞曾被认为是红花高盆樱(Cerasus cerasoides var. rubea) 的园艺品种,但分子标记结果却聚在钟花樱(C. campanulata)种系,可见红霞的种系 归属存疑,对今后的育种及栽培工作极为不利。为了探索红霞的种系问题,该研究以红 霞的叶片DNA 为材料,应用Illumina 软件对叶绿体基因组特征进行测序,通过SPAdes 3.13.0, Gapcloser 1.12 和 CPGAVAS2 2.0 软件进行组装、注释,之后使用 MISA 和 Geneious 10.0 软 件对叶绿体基因组特征进行分析;并使用 RAxML 8.0 软件构建 Cerasus 分支系统发育树。 分析了红霞在樱属植物的系统关系。结果表明: (1)红霞的叶绿体全基因组长度 为 157 832 bp, 鸟嘌呤(GUANINE, G)、胞嘧啶(CYTOSINE, C)含量为 36.73 %,包含一 对反向重复区(Inverted Repeat Sequence, IR, 26 381 bp),由小单拷贝区(Short Single Copy, SSC, 19 120 bp)和大单拷贝区(Long Single Copy, LSC, 85 950 bp)分开,共编码 128 个基 因,包括 84 个蛋白质编码基因、36 个 tRNA 基因和 8 个 rRNA 核糖体基因;(2)通过樱 属 16 个叶绿体全基因组的最大似然法系统发育树系统分析,发现红霞与大叶早樱(C. subhirtella)和日本樱花(C. yedoensis)一支聚为姊妹群,而与高盆樱(C. cerasoides)的亲 缘关系较远。结合已报道的细胞核 DNA 研究结果:红霞等品种均聚在钟花樱种系, 而不是高盆樱种系,该研究推测:红霞可能不是高盆樱的品种,而有可能是钟花樱和 大叶早樱或日本樱花的杂交品种。该研究结果将为云南樱花品种红霞的起源和遗传育种、 高盆樱的品种鉴定与分类等研究提供一定的参考资料。
分类: 医学、药学 >> 预防医学与公共卫生学 提交时间: 2024-07-31 合作期刊: 《中国全科医学》
摘要: 背景随着人口老龄化,压力性损伤(PI)的发病率逐渐增加,这不仅严重影响了患者的生存质量,还增加了医保支出。然而,PI的早期发现和准确分期极大地依赖于专业培训。目的 构建并测试一个用于PI自动检测和分期的人工智能模型,目的是提高PI诊断的实时性、准确性和客观性。方法 从常熟市第一人民医院压疮电子化管理系统中选取了2021年1月—2024年2月期间的693张PI图片,并按照2019NPUAP指南分为6期,包括:Ⅰ期154张、Ⅱ期188张、Ⅲ期160张、Ⅳ期82张、不可分期52张、深部组织损伤期57张。利用基于5种不同版本大小的YOLOv8神经网络和迁移学习,建立针对PI的深度学习目标检测模型。模型评价指标包括精确度、准确率、灵敏度、特异度及检测速度等。最后,通过UltralyticsHub平台将模型部署到手机应用程序(App)中,实现AI模型在临床工作中的应用。结果 在对包含142张PI图像的测试集进行评估时,YOLOv8l版本在确保高精确度(0.827)的同时,也展现了较快的推理速度(68.49fps),与其他YOLO版本相比,在精确度与速度之间取得了最佳的平衡。具体而言,其在所有类别上的整体准确率为93.18%,灵敏度为76.52%,特异度为96.29%,假阳性率为3.72%。在6个PI分期中,模型对“Ⅰ期”的准确率最高,达到95.97%;Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期、深部组织损伤期、不可分期,分别取得了91.28%、91.28%、91.95%、95.30%和93.29%的准确率。就处理速度而言,平均每秒可处理68.49张PI图像。结论 基于YOLOv8l网络的AI模型能够快速、准确地检测和分期PI。将该模型部署到手机App中,能够在临床实践中便携使用,具有很大的临床应用潜力。