• 水涝胁迫下辣椒转录组特征分析及EST-SSR 标记开发

    分类: 生物学 >> 植物学 提交时间: 2022-12-29 合作期刊: 《广西植物》

    摘要: 为开发适当的生物学工具以探索辣椒对水涝胁迫应答的分子机制,该文对不同淹水处理的 辣椒样本进行转录组分析,获得了丰富的序列数据,并在此基础上对 SSR 分子标记进行挖掘。结果 表明:(1)辣椒转录组检测共获得 128 939 条 Unigene,其总全长与均长以及 GC 含量分别是 55 082 725 bp、1 101 bp 和 40.57%。与七大功能数据库进行比较,分别有 102 123(NR:79.20%)、110 157 (NT:85.43%)、70 203(SwissProt:54.45%)、73 539(KOG:57.03%)、77 646(KEGG:60.22%)、 77 442(GO:60.06%)以及 68 216(Pfam:52.91%)个 Unigene 获得功能注释。发现脂质代谢、碳 水化合物代谢、氨基酸代谢、环境适应、次级代谢物生物合成、信号转导和翻译等途径在辣椒水涝 胁迫应答中起重要作用。(2)从辣椒转录组数据中发掘到26 574 个SSR 位点分布在24 889 个Unigene 中。SSR 的出现频率为 20.61%,其中单核苷酸重复所占比例(37.26%)最高,其次是三核苷酸(31.00%) 和二核苷酸(25.44%)重复类型,三者占 EST-SSR 总数的 93.70%。在单核苷酸与二核苷酸中最多 的基序类型为 A/T、AG/CT 和 TC/GA,然后是 AT 和 TA;三核苷酸中最常见的基序类型是 TTG/CAA 和 ACA/TGT。(3)用 Primer 3 设计了 EST-SSR 引物 10 002 对,随机选择 30 对引物进行 PCR 扩增, 均可获得有效扩增。通过 3 份辣椒材料进行扩增,其中 7 对引物可以扩增出目标条带。综上所述, 在辣椒中优势 SSR 重复类型的基序结构和其他品种基本相近,并初步探索了辣椒水涝胁迫应答的分 子机制,开发了 EST-SSR 标记,为辣椒耐涝遗传育种提供参考。

  • 中国空间站望远镜(CSST) 密集星场天体自行研究

    分类: 天文学 提交时间: 2023-12-13 合作期刊: 《天文学进展》

    摘要: 对密集星场自行研究是天体测量领域的难题之一,深刻地影响着相关领域的发展。空间 观测对于研究密集星场的优势十分明显。CSST 可以提供高精度绝对自行,弥补 HST 在观测覆 盖范围以及 Gaia 在暗弱星等方面的不足。银河系核球区作为典型的密集星场天区,具备很强科 学价值,但数据处理方面面临很大挑战。以银河系核球区为例,验证了绝对自行处理方法,并对 CSST 密集星场的观测策略提出建议。基于 CSST 核球区仿真观测图像,开展数据处理方法的 研究和验证。使用两种定心方法并进行比较,定心精度可达近 0.03 ∼ 0.08 pixel。以 10 a 为基 线长度,对比了不同观测方法下所得到绝对自行的精度,发现等间隔观测的策略最优。基于此方 法,得出结论:对于 18 ∼ 24 mag 的恒星,通过 6 次观测,可以得到好于 0.2 mas/a 的绝对自 行精度。最后,估计了不同时间基线和恒星速度下视差对自行的影响。