三脉水丝梨叶绿体基因组特征及系统发育分析
后印本
Analysis of chloroplast genomic characteristics and phylogeny in Sycopsis triplinervia
摘要: 三脉水丝梨（Sycopsis triplinervia）是金缕梅科（Hamamelidaceae）水丝梨属（Sycopsis）
的一种常绿灌木。由于水丝梨属的系统发育地位仍存在争议且与假蚊母属（Distyliopsis）、
蚊母树属（Distylium）等近缘属之间的亲缘关系尚不明确，该研究对三脉水丝梨的叶绿体基
因组进行了测序与组装，并结合公共数据库中金缕梅科其他物种的叶绿体基因组数据，开展
了比较基因组分析和叶绿体基因组系统发育分析。结果表明：（1）三脉水丝梨基因组大小
为159 375 bp，共编码133 个基因，包括8 个rRNA 基因、37 个tRNA 基因、87 个蛋白编
码基因和1 个假基因。（2）在其基因组中共检测到33 个散在重复序列、39 个串联重复序
列和82 个简单重复序列（SSRs）。（3）密码子偏好以A/U 结尾，共包含9 个最优密码子
且密码子偏好主要受自然选择的影响。（4）与近缘种相比，三脉水丝梨的叶绿体基因组整
体较为保守。从水丝梨属中筛选到的15 个高变异区域具有潜在用于分子鉴定的价值。（5）
系统发育分析显示，金缕梅科为单系类群，金缕梅属（Hamamelis）、白缕梅属（Parrotiopsis）、
水丝梨属、假蚊母属、波斯铁木属（Parrotia）和蚊母树属6 个属形成了一个强力支持的单
系分支，几个属之间具有较近的亲缘关系，其中三脉水丝梨与该分支中的其他类群互为姐妹
群。然而，水丝梨属、波斯铁木属、假蚊母属和蚊母树属均非单系。该研究为金缕梅科的系
统发育研究提供了重要的基础数据和参考。
版本历史
| [V1] |
2025-03-19 11:24:43 |
ChinaXiv:202503.00187V1
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