基于SLAF-Seq 的广西八角种质资源遗传多样性分析
后印本
Genetic diversity analysis of Illicium verum germplasm resources in Guangxi using SLAF-Seq
摘要: 八角作为广西重要的特色经济林木之一,遗传变异丰富。为揭示广西八角种质资源
遗传多样性,该研究运用SLAF-Seq 技术,对源自广西不同地理区域的53 份八角居群样本
及42 份人工筛选的优良种质样本的单核苷酸多态性(SNP)位点进行了深入挖掘;基于SNP
多态性,对这些八角样本进行了群体遗传结构和遗传多样性分析。结果表明:(1)从95 份
八角样本中,共获得1 588 Mb 测序数据和643 690 个SLAF 标签,其中包含74 434 个多态
性SLAF 标签,经过滤后得到2 690 564 个群体SNP。(2)95 份八角样本可分为两个主要类
群,其中桂北、桂西及部分桂中部地区居群样本聚为一个类群;42 份人工筛选优良种质与
桂南、桂东以及部分桂中地区的居群样本聚为另一类群。(3)桂北地区居群的遗传多样性最
高,其次依次为桂东、桂中、桂西和桂南地区居群样本,而人工筛选的八角优良种质的遗传
多样性最低。综上,该研究基于SLAF-Seq 开发的SNP 分子标记能够有效分析广西不同地
区居群样本以及人工筛选的优良种质的遗传多样性,对广西八角的种质资源保护与利用以及
优良种质筛选提供了重要的理论参考依据。
版本历史
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2025-03-05 23:30:43 |
ChinaXiv:202503.00040V1
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