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垂穗披碱草TCP转录因子 家族 鉴定 及激素响应模式分析 后印本

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Characterization of TCP transcription factors in Elymus nutans and analysis of phytohormones response patterns

摘要: 垂穗披碱草(Elymus nutans)是青藏高原地区的优质牧草,具有较高的生态价值和经济价值。TCP是植物特有的转录因子家族,参与调控植物叶片发育、侧枝形成、植物激素合成与信号转导等生理过程。为鉴定垂穗披碱草TCP转录因子家族成员,该研究利用SMRT(single molecule real-time)测序技术获得了垂穗披碱草全长转录组数据,并对不同激素处理后的垂穗披碱草叶片进行Illumina测序,以探究EnTCPs基因在不同激素处理下的表达模式。结果表明:(1)垂穗披碱草全长转录组测序共获得90 956条非冗余转录本。(2)基于全长转录组数据共鉴定到26个EnTCPs,氨基酸数介于186~575 aa,亚细胞定位预测均位于细胞核。(3)根据进化树的分支情况可将26个EnTCPs分为Class I,Class II-a(CIN)和Class II-b(CYC/TB1)3个亚家族,保守结构域分析表明它们均含有TCP结构域。(4)不同激素处理后的表达模式分析表明,7个EnTCPs家族成员(En108950、En35573、En10347、En16325、En128790、En10346和En14028)在激素处理后上调/下调表达,它们可能参与了激素合成与信号转导通路;QRT-PCR分析结果显示En35573和En14028参与生长素响应,En108950、En10347、En128790、En10346和En14028均参与细胞分裂素响应,En14028参与脱落酸响应,En108950参与茉莉酸响应,而En16325可能参与多种激素信号转导通路。该研究结果为后续EnTCPs基因功能研究奠定了基础,为研究EnTCPs对激素响应的分子机制提供了参考依据。

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[V1] 2024-07-17 00:11:12 ChinaXiv:202407.00174V1 下载全文
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