提交时间： 2024-04-03 合作期刊: 《农业图书情报学报》
摘要： [目的/ 意义]随着农业知识图谱数据规模的增长，图谱的节点和关系复杂度不断提升，这对其训练和表示提出了新的 挑战。在此背景下，探索如何在保全知识图谱结构的同时降低资源消耗并加快嵌入速度具有重要的研究和应用意义。[方法/ 过 程]针对这一问题，本研究提出了一种基于HARP 框架的农业知识图谱层次表示模型。该模型利用农业知识图谱的层次性特征， 采用一种改进的基于关系路径随机行走策略，有效地保留了图谱中节点的层次性和非对称关系结构。[结果/ 结论] 1)与HARP 框架相比，使用LEIDEN 的HRWP 模型能更好地保留空间结构，并快速收敛了速度；2)采用HRWP 的融合模型训练时 间基本小于二者训练时间总和，且对原算法时间复杂度影响较小；3)结合HRWP 的传统算法各指标平均提高2%，非神经网络 模型有显著提升。综上，认为模型可以准确表示农业知识图谱并有效缩短训练时间。
分类： 生物学 >> 生物工程 提交时间： 2017-07-24 合作期刊: 《中国生物工程杂志》
摘要： 目的：本研究在之前压应力细胞模型的基础上，尝试建立3D水凝胶细胞模型，同时采用不同强度、频率、时间对MC3T3-E1细胞进行机械加压干预，观察压应力对成骨细胞分化的影响，探讨促进成骨细胞分化的适宜压应力方案。方法：成骨细胞MC3T3-E1复苏后常规培养，3D水凝胶建模成功，细胞种板后，第二天对细胞进行压应力干预，设计不同强度、频率的压应力梯度方案对3D水凝胶进行干预，对照组细胞不进行干预正常培养。在此基础上，通过统计学计算出有效的强度和频率压应力方案，后以一个方案按照不同干预时间施加压应力。加压干预结束后即刻收集细胞，对样本中的ATF4、ALP、Runx2、Osteocalcin、RANKL 和RANK mRNA进行定量检测。结果：针对不同强度和频率梯度压应力的数据，先采用双因素方差分析，发现不同频率压应力对RANKL和RANK作用显著（P＜0.05）；强度和频率对ALP（P＜0.05）、Runx2（P＜0.01）交互作用显著。针对不同时间梯度压应力的数据，采用单因素方差分析，发现4h加压Runx2的表达量比12h加压的高（P＜0.05）；4h加压RANKL的表达量比12h加压的低（P＜0.05）。结论：在3D水凝胶模型中，以1%强度、0.5Hz频率、4h的压应力干预方案能够促进成骨细胞系的生长。
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