斑地锦RT-qPCR 内参基因的筛选

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-05-27 合作期刊: 《广西植物》

宋美玲 黄胜和 陈祖杰 邹嘉轩 刘欢胜 全文军

摘要： 实时荧光定量 PCR（RT-qPCR）的前提条件之一是具有合适的内参基因。为筛选斑地锦（Euphorbia maculata L.）合适的不同生长期不同组织 RT-qPCR 内参基因，利用同源克隆法克隆斑地锦 GAPDH、EF-1α、act、UBQ、TUB-α、eIF-4A、CYP 等基因片段，RT-qPCR检测 7 个候选内参基因在斑地锦不同生长期根、茎、叶和果实中的表达情况，geNorm、 NormFinder 和 BestKeeper 等生物学软件对各候选基因表达稳定性进行评价。结果显示：克隆的 GAPDH、EF-1α、act、UBQ、TUB-α、eIF-4A、CYP 基因片段为 729、808、753、422、 233、656、313 bp，分别编码 242、269、250、140、77、218、103 个氨基酸，与其他植物相应氨基酸序列的最高同源性均在 85%以上。综合 3 个分析软件对各生长期不同组织中表达 稳 定 性 进 行 的 评 价 得 出 ， 表 达 稳 定 性 排 名 为UBQ>EF-1α>TUB-α>eIF-4A>GAPDH>CYP>act。因此，可以选取 UBQ 作为斑地锦 RT-qPCR分析的内参基因，用于不同生长期基因组织特异性表达研究。

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