分类: 数学 >> 计算数学 提交时间: 2019-08-27
摘要: 本文基于阻尼块反幂法与子空间投影算法设计了一种求解特征值问题的广义共轭梯度算法, 同时也实现了相应的计算软件包. 然后对算法和计算过程进行了一系列的优化来提高算法的稳定性、计算效率和并行可扩展性, 使得本文的算法适合在并行计算环境下求解大规模稀疏矩阵的特征值. 所形成的软件包是基于Matrix-Free和Vector-Free设计的, 可以应用于任意的矩阵向量结构. 针对几种典型矩阵的测试结果表明本文的算法和软件包不但具有良好的数值稳定性, 同时相比于SLEPc软件包中的LOBPCG以及Jacobi-Davidson解法器有2-6倍的效率提升. 软件包的网址: https://github.com/pase2017/GCGE-1.0.
分类: 生物学 >> 生物工程 提交时间: 2017-11-21 合作期刊: 《中国生物工程杂志》
摘要: CRISPR / Cas9系统是细菌体在长期进化过程中抵御病毒或噬菌体DNA的一种适应性免疫系统。尽管近年来的一些基因编辑技术,例如锌指核酸酶、转录激活因子效应物核酸酶等,已经给基因编辑带来了许多便利。但CRISPR / Cas9系统以其独特的优势,给基因编辑领域带来了革命性的变化。CRISPR / Cas9系统在生物研究、基因相关疾病的治疗、疾病的基因水平研究等多方面都有广泛的应用。本文综述近年来CRISPR / Cas9运输系统的研究进展及其在基因相关疾病方面取得的应用成果,分析慢病毒和腺相关病毒运载基因编辑元件的利弊,并探讨CRISPR / Cas9系统在基因编辑效率方面的影响因素及仍然存在的问题。
分类: 生物学 >> 生物工程 提交时间: 2017-11-21 合作期刊: 《中国生物工程杂志》
摘要: CRISPR / Cas9系统是细菌体在长期进化过程中抵御病毒或噬菌体DNA的一种适应性免疫系统。尽管近年来的一些基因编辑技术,例如锌指核酸酶、转录激活因子效应物核酸酶等,已经给基因编辑带来了许多便利。但CRISPR / Cas9系统以其独特的优势,给基因编辑领域带来了革命性的变化。CRISPR / Cas9系统在生物研究、基因相关疾病的治疗、疾病的基因水平研究等多方面都有广泛的应用。本文综述近年来CRISPR / Cas9运输系统的研究进展及其在基因相关疾病方面取得的应用成果,分析慢病毒和腺相关病毒运载基因编辑元件的利弊,并探讨CRISPR / Cas9系统在基因编辑效率方面的影响因素及仍然存在的问题。