分类: 生物学 >> 生物工程 提交时间: 2018-05-23 合作期刊: 《中国生物工程杂志》
摘要: 开展雨生红球藻基因组测序研究,对于解读绿藻起源与进化及生物逆境胁迫响应机理,及推动雨生红球藻产业发展都具有重要意义。利用Illumina Hiseq 2500对雨生红球藻(Haematococcus pluvialis)进行高通量测序,获得低覆盖度全基因组草图。通过计算k-mer分布预测该基因组草图大小约为547 Mbp,GC含量为59.2 %,为纯合或单倍体。共得到11,059个预测基因,平均基因长度为1,711 bp,平均CDS长度为681 bp;平均每个基因包含3.2个外显子,外显子平均长度为353 bp。代谢通路分析表明,具有完整的糖酵解、三羧酸循环、磷酸戊糖途径、嘌呤和嘧啶合成等基本代谢通路。