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  • 刺桑皮正丁醇部位化学成分研究

    分类: 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间: 2022-03-30 合作期刊: 《广西植物》

    摘要:为研究刺桑(Streblus ilicifolius)皮正丁醇部位的化学成分,该文采用硅胶、ODS、Sephadex LH-20、反相半制备高效液相等色谱方法对刺桑皮正丁醇萃取部位进行分离、纯化,综合理化性质及波谱数据鉴定其化合物的结构。结果表明:从刺桑皮正丁醇萃取物中分离得到16个化合物,分别鉴定为icariside E5 (1)、裂环异落叶松脂醇-9-O-β-吡喃葡萄糖苷(2)、2,4,6-三甲氧基苯酚-1-O-β-D-葡萄糖苷(3)、9-O-β-glucopyranosyl trans-cinnamyl alcohol (4)、3,4,5-三甲氧基苯酚-1-O-β-呋喃芹糖基-(1"→6´)-β-吡喃葡萄糖苷(5)、3-羟基-4,5-二甲氧基苯酚-β-D-吡喃葡萄糖苷(6)、2,6-二甲氧基-4-羟基苯酚-1-O-β-D-吡喃葡萄糖苷(7)、isotachioside (8)、ficuscarpanoside A (9)、uridine (10)、methyl syringate 4-O-β-D-glucopyranoside (11)、3,4,5-三甲氧基苯酚-β-D-吡喃葡萄糖苷(12)、木犀草素(13)、人参皂苷Rg1 (14)、(+)-lyonirenisol-3α-O-β-D-glucopyranoside (15)、myricetin 3-neohesperidoside (16)。所有化合物均为首次从该属植物中分离得到。

  • 一种基于BERT和文本相似度的先进的ICD9术语标准化方法

    分类: 计算机科学 >> 自然语言理解与机器翻译 提交时间: 2020-10-27

    摘要: ICD-9术语标准化任务旨在将医生在病历中记录的口语术语标准化为《国际疾病分类》(ICD-9)第九版中定义的标准术语。在本文中,我们首先提出一种基于BERT和文本相似度的方法(BTSBM),该方法将BERT分类模型与文本相似度计算算法相结合:1)使用N-gram算法为每种口语术语生成候选标准术语集(CSTS) ,用作下一步的训练数据集和测试数据集; 2)使用BERT分类模型对正确的标准术语进行分类。在这种BTSBM方法中,如果采用较大规模的CSTS作为测试数据集,则训练数据集也需要保持较大规模。但是,每个CSTS中只有一个正样本。因此,扩大规模将导致正负样本比例的严重失衡,这将严重降低系统性能。如果我们将测试数据集保持相对较小,则CSTS准确性(CSTSA)将大大降低,这将导致非常低的系统性能上限。为了解决上述问题,我们然后提出了一种优化的术语标准化方法,称为先进的BERT和基于文本相似性方法(ABTSBM),其中1)使用大规模初始CSTS来维持较高的CSTSA以确保较高的系统性能上限; 2)根据身体结构对CSTS进行降噪,以减轻正负样本的不平衡而不降低CSTSA; 3)引入focal loss损失函数以进一步促进正负样本的平衡。实验表明,ABTSBM方法的精度高达83.5%,比BTSBM高0.6%,而ABTSBM的计算成本比BTSBM低26.7%。

  • 樟树长链脂肪酰基CoA 合成酶基因9 克隆与表达分析

    分类: 农、林、牧、渔 >> 植物保护学 提交时间: 2018-06-22 合作期刊: 《广西植物》

    摘要:长链脂肪酰基CoA 合成酶(long chain fatty aycl-coA synthetases, LACSs)亚家族在植物脂肪酸代谢中具有重要作用。樟树(Cinnamomum camphora (L.) Presl.)属富油木本植物,其籽油富含中链脂肪酸、但生物合成机制尚未可知。本研究以樟树转录组数据为基础,通过生物信息学方法筛选获得了拟南芥AtLACS9 同源候选基因CcLACS9。通过PCR 法克隆了CcLACS9全长cDNA 序列,相关软件预测其编码697 个氨基酸及享有植物LACS 亚家族成员3 个特征motifs。在Δlacs 缺陷型酵母互补测试中,以油酸作为唯一外源脂肪酸、转化了CcLACS9 的突变型酵母恢复正常生长,证明CcLACS9 具有典型的脂肪酰基CoA 合成酶的功能。为探究CcLACS9 是否参与了樟树籽油生物合成,我们进一步研究了其组织表达模式和在种子发育过程中其表达量与籽油累积量之间的关系。实时荧光定量PCR 分析显示CcLACS9 基因在种仁与花中优势表达,种仁中相对表达量是根中的17.74 倍。之后随机测定调查了30 棵成年樟树成熟期种子千粒重、籽油含量和中链脂肪酸比例等指标。根据仁油含量将测试群体划为高、中、低三个不同品级,并在各品级中挑选3 棵单株、逐月关联分析其仁油含量与CcLACS9 相对表达量。结果显示:在种仁发育前期,仁油含量和CcLACS9 表达量都持续上升且二者呈正相关性,8 月份为CcLACS9 表达量峰值期;9 月下旬后,仁油含量趋向稳定但CcLACS9 表达量仍处于较高水平但呈现下降趋势,二者无明显相关性。LACS 亚家族在植物进化中较为保守,同源基因在不同植物中具有相同或相似的功能,该研究结果暗示CcLACS9 可能拥有AtLACS9 相似的生物学功能,即在樟树种仁油酯合成和累积过程起重要作用。

  • 骨形成蛋白9对人膀胱癌BIU-87细胞增殖和迁移的影响

    分类: 生物学 >> 生物工程 提交时间: 2018-03-22 合作期刊: 《中国生物工程杂志》

    摘要:目的:人骨形成蛋白9(Bone Morphogenetic Protein 9,BMP9)对人膀胱癌BIU-87细胞增殖和迁移的影响。方法 使用过表达BMP9基因的腺病毒(AdBMP9)感染BIU-87细胞,采用定量PCR检测BMP9 mRNA的表达,Western-blot检测BMP9蛋白及BMP9下游相关信号通路蛋白的表达;MTT及集落形成试验检测BIU-87细胞增殖能力;划痕愈合试验及TranswellTM小室迁移试验检测BIU-87细胞迁移能力。结果 感染AdBMP9后,BIU-87细胞中BMP9的mRNA水平和蛋白水平均显著增加;过表达BMP9后,BIU-87细胞的体外增殖和迁移能力明显增加;Western-blot结果显示BMP9可明显激活AKT信号通路。 结论 高表达BMP9可能通过激活AKT信号通路促进人膀胱癌BIU-87细胞的增殖和迁移。

  • SFRP5抑制BMP9诱导人脐带间充质干细胞成骨分化的实验研究

    分类: 生物学 >> 生物工程 提交时间: 2018-03-13 合作期刊: 《中国生物工程杂志》

    摘要:目的:探讨脂肪因子分泌型卷曲相关蛋白(Secreted frizzled-related protein 5,SFRP5)对骨形态发生蛋白9 (bone morphogenetic protein 9,BMP9)诱导人脐带间充质干细胞( human umbilical cord-derived mesenchymal stem cells,hUC-MSCs)成骨分化的影响。方法:将人脐带间充质干细胞根据不同的处理因素分为4个组:对照组、BMP9组、BMP9+SFRP5组和SFRP5 组;分别在3、5和7天进行ALP活性读数,7天进行ALP染色,21天进行茜素红染色检测钙盐沉积以及油红O染色;收集不同组的细胞用于裸鼠皮下注射成骨模型的建立,4周后取出离体骨进行Micro-CT 扫描和分析,获取的标本进行HE、Masson染色、Alcian blue染色及油红O染色检测。Western blot检测成骨分化相关蛋白runx2和OPN的表达。结果:BMP9 组的ALP活性读数及染色结果和茜素红染色均较对照组增加,而BMP9+SFRP5组则较BMP9组降低;BMP9处理后出现少量脂滴,而BMP9+SFRP5组脂滴明显增加,SFRP5组脂滴最多;裸鼠皮下注射成骨模型的观察结果显示,对照组和SFRP5组没有形成肉眼可见的皮下包块,BMP9组和BMP9+SFRP5组能生成异位骨;4W后观测大体标本以及进行MicroCT检测发现BMP9+SFRP5组的骨密度值小于BMP9组(P<0.05)。HE、Masson染色,Alcian blue染色结果显示,BMP9组的骨分化程度大于BMP9+SFRP5,油红O染色结果示BMP9+SFRP5组有较多的成脂分化;SFRP5能抑制BMP9诱导的Runx2、OPN的蛋白表达。结论:SFRP5抑制BMP9诱导的人脐带间充质干细胞成骨分化。

  • 丙泊酚下调水通道蛋白3和基质金属蛋白酶-9表达抑制人肺癌A549细胞的侵袭力

    分类: 医学、药学 >> 基础医学 提交时间: 2018-01-25 合作期刊: 《南方医科大学学报》

    摘要:目的 探讨丙泊酚对人肺癌A549细胞水通道蛋白3(AQP-3)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)表达及其侵袭力的影响。方法 A549细胞经丙泊酚不同剂量(25、 50、100 μmol/L)和不同时间(12、 24 h)处理。用RT-PCR方法观察丙泊酚对A549细胞AQP-3 mRNA的作用, 用Western Blot方法和Transwell侵袭实验分别检测不同浓度丙泊酚作用24 h对A549细胞AQP-3、MMP-9蛋白 表达和细胞侵袭力的影响。结果 与空白组比较,25、50、100 μmol/L丙泊酚24 h处理组对AQP-3 mRNA表达的最大抑制比 值为0.13,最小0.41; 12 h处理组最大抑制比值0.19,最小0.65,差异有统计学意义(P<0.05);丙泊酚100 μmol/L组24 h达到最 大抑制效果(0.13±0.035)。25、 50、100 μmol/L丙泊酚24 h处理组AQP-3蛋白表达(0.91±0.009, 0.60±0.020, 0.57±0.006)和50、 100 μmol/L丙泊酚24 h处理组MMP-9蛋白表达(0.65±0.006, 0.46±0.021),较空白组明显降低(P<0.05)。25、 50、100 μmol/L丙泊酚 24 h处理组的穿膜细胞数(122.55±17.20, 96.33±5.82, 74.33±2.85),较空白组(199.33±23.88)明显减少(P<0.05)。结论 丙泊酚 50、100 μmol/L处理24 h,可下调人肺癌A549细胞AQP-3 mRNA、AQP-3蛋白和MMP-9蛋白的表达,抑制A549细胞的侵袭力。

  • Kiss-1基因通过NF-κB信号传导通路抑制人结直肠癌HCT116细胞迁移

    分类: 医学、药学 >> 基础医学 提交时间: 2017-12-07 合作期刊: 《南方医科大学学报》

    摘要:目的 探讨Kiss-1基因抑制人结直肠癌细胞转移能力与NF-κB信号传导通路的相关性。方法 构建重组pGC-LV-Kiss-1-EGFP慢病毒载体并转染人结直肠癌HCT116细胞,实验分为空白对照组(CON组)、慢病毒空载体阴性对照组(NC组)、Kiss-1基因过表达组(OE组)。CCK-8(Cell Counting Kit-8)法检测转染前后细胞增殖能力的变化,Transwell法分别检测转染前后细胞的侵袭和迁移能力的变化。Western-blot法检测转染前后NF-κB信号传导通路中抑制性蛋白I-κB以及下游效应蛋白MMP-9表达量的变化。结果 OE组HCT116细胞中I-κB的表达含量较CON组、NC组明显升高(P<0.05),下游效应蛋白MMP-9的表达量明显下降(P<0.05),差异具有统计学意义。OE组较CON组、NC组细胞增殖受到明显抑制(P<0.05),细胞侵袭、迁移能力亦出现明显抑制(P<0.05)。结论 重组pGC-LV-Kiss-1-EGFP慢病毒转染人结直肠癌HCT116细胞后,可能通过NF-κB信号传导通路途径抑制其增殖、侵袭和迁移能力

  • 肿瘤坏死因子-α对骨髓源性肥大细胞表达MMP-3、MMP-9、IL-17的影响

    分类: 医学、药学 >> 基础医学 提交时间: 2017-12-07 合作期刊: 《南方医科大学学报》

    摘要:目的 肿瘤坏死因子-α(TNF-α)对骨髓源性肥大细胞(BMMCs)分泌MMP-3、MMP-9、IL-17的影响。方法 原代培养小鼠BMMCs,将培养8周的BMMCs种植于12孔板中。细胞分为4个组:BMMCs+PBS组(对照组)、BMMCs+2 ng/mL TNF-α组(2 ng/mL组)、BMMCs+10 ng/mL TNF-α组(10 ng/mL组)、BMMCs+50 ng/mL TNF-α组(50 ng/mL组),不同浓度TNF-α与BMMCs作用后,在12、24 h收集细胞,用实时荧光定量逆转录聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction, real-time PCR),在mRNA水平检测MMP-3、MMP-9、IL-17的表达。结果 培养12 h后,2 ng/mL组、10 ng/mL组、50 ng/mL组MMP-3、MMP-9、IL-17 mRNA的表达均高于对照组(P<0.05),并且随着TNF-α浓度的上升mRNA的表达显著升高(P<0.05)。24 h结果与12 h结果一致,24 h与12 h之间比较,除50 ng/mL组MMP-3 mRNA的表达无差异(P>0.05),其余各组之间MMP-3、MMP-9、IL-17mRNA的表达显著升高(P<0.05)。结论 TNF-α可以上调BMMCS表达MMP-3、MMP-9、IL-17,且具有浓度依赖性和时间依赖性。

  • 电站锅炉关键部件材料高温蒸汽氧化研究进展

    分类: 材料科学 >> 材料科学(综合) 提交时间: 2016-11-14 合作期刊: 《中国腐蚀与防护学报》

    摘要:

    因其特殊的服役环境,电站锅炉关键材料需要同时满足力学性能与抗高温腐蚀性能的需求。本文从高温蒸汽氧化的角度,讨论了现有锅炉合金及下一代电站合金的高温蒸汽腐蚀研究进展和高温蒸汽氧化机理。

  • Circulating Peptidome to Indicate the Tumor-resident Proteolysis

    分类: 生物学 >> 生物物理学 提交时间: 2016-05-12

    摘要:Tumor-resident proteases (TRPs) are regarded as informative biomarkers for staging cancer progression and evaluating therapeutic efficacy. Currently in the clinic, measurement of TRP is dependent on invasive biopsies, limiting their usefulness as monitoring tools. Here we identified circulating peptides naturally produced by TRPs, and evaluated their potential to monitor the efficacy of anti-tumor treatments. We established a mouse model for ovarian cancer development and treatment by orthotopic implantation of the human drug-resistant ovarian cancer cell line HeyA8-MDR, followed by porous silicon particle-or multistage vector (MSV) -enabled EphA2 siRNA therapy. Immunohistochemistry staining of tumor tissue revealed decreased expression of matrix metallopeptidase 9 (MMP-9) in mice exhibiting positive responses to MSV-EphA2 siRNA treatment. We demonstrated, via an ex vivo proteolysis assay, that C3f peptides can act as substrates of MMP-9, which cleaves C3f at L-1311-L-1312 into two peptides (SSATTFRL and LWENGNLLR). Importantly, we showed that these two C3f-derived fragments detected in serum were primarily generated by tumor-resident, but not blood-circulating, MMP-9. Our results suggested that the presence of the circulating fragments specially derived from the localized cleavage in tumor microenvironment can be used to evaluate therapeutic efficacy of anti-cancer treatment, assessed through a relatively noninvasive and user-friendly proteomics approach.