分类： 生物学 >> 生物化学 提交时间： 2022-04-04
摘要： [目的]通过对大鼠注射牛血清白蛋白和氢氧化铝佐剂，观察尿液蛋白质组中免疫系统的变化。 [方法]本研究对大鼠大腿肌肉注射牛血清白蛋白和氢氧化铝佐剂，收集尿液，通过液相色谱联用质谱（LC-MS/MS）鉴定差异蛋白，使用IPA软件对差异蛋白进行生物学通路的分析，观察大鼠尿蛋白中免疫系统的变化情况。 [结果]15只大鼠分别肌肉注射生理盐水、氢氧化铝佐剂、牛血清白蛋白、氢氧化铝佐剂和牛血清白蛋白（BSA）混合物，构建对照组、佐剂组、BSA组、混合组模型。不同组别之间两两比较差异蛋白得到相关生物学通路，发现尿液中可以观察到佐剂帮助牛血清白蛋白更早的激发免疫系统发生反应。并且在尿液中还观察到混合组先后激发炎症反应、T细胞活化、抗原提呈细胞相关、B细胞相关等免疫相关通路。 [讨论]我们可以在早期从尿液蛋白质组中观察到免疫系统的变化，这为以后免疫系统的研究，甚至加快疫苗的研发提供一些新的线索和依据。
分类： 生物学 >> 生物化学 提交时间： 2022-01-09
摘要： [目的]通过DEN诱导的肝癌-炎癌模型，观察疾病不同阶段尿液蛋白质组动态变化过程。 [方法]本研究腹腔注射DEN构建大鼠肝癌-炎癌模型，每周收集尿液，通过液相色谱联用质谱（LC-MS/MS）鉴定差异蛋白，使用IPA软件对差异蛋白进行生物学通路的分析，观察大鼠肝癌-炎癌模型中疾病不同阶段尿蛋白变化情况。 [结果]15只实验大鼠通过DEN诱导，构建了从肝炎-肝硬化-肝癌疾病模型的不同时期，并且每只大鼠由于个体差异出现了疾病进展快慢不同的现象。每只大鼠在不同疾病时间点都出现了较多的差异蛋白，不同大鼠的差异蛋白都富集到了相同的与肝脏损伤、炎症病变有关、与肿瘤的发生有关、与肿瘤潜在的治疗靶点有关的生物学通路。 [讨论]我们可以在肝癌-炎癌模型各阶段观察到尿液蛋白质组不同的变化，并且不同大鼠由于个体差异会出现疾病进展不同的现象，这提示我们之后需要更加注意检测的个体化、精准化。
分类： 生物学 >> 生物工程 提交时间： 2017-07-24 合作期刊: 《中国生物工程杂志》
摘要： 为获得具有免疫原性的TK1重组蛋白。通过构建能够表达TK1蛋白的重组菌BL21-pET32a-TK1,采用大肠杆菌pET32a表达系统，优化IPTG浓度、诱导温度、诱导时间使BL21-pET32a-TK1重组菌表达目的蛋白的作用条件最佳。表达产物用镍离子亲和层析纯化获得TK1蛋白，并用SDS-PAGE和western blot进行检测。用TK1重组蛋白免疫BALB/c小鼠制备单克隆抗体，检测蛋白免疫原性。实验结果表明：成功构建能够表达TK1蛋白的重组菌BL21-pET32a-TK1，在37℃条件下，IPTG浓度为0.2mM/L、诱导6h时重组蛋白TK1表达量最高。镍离子亲和层析梯度洗脱在80mM咪唑条件下TK1蛋白纯度最大，灰度分析为87.3%，浓缩后蛋白浓度为5.96mg/ml。用该蛋白制备杂交瘤共获得10株稳定分泌TK1抗体的阳性单克隆细胞株，表明TK1重组蛋白具有较好的免疫原性。本实验成功获得可溶性、抗原活性高、免疫原性强的TK1重组蛋白，为肿瘤科学及临床应用研究提供物质支撑。
分类： 天文学 >> 天文学 提交时间： 2022-04-14 合作期刊: 《天文研究与技术》
摘要： 太阳黑子是发生在太阳光球层的现象，对太阳耀斑预测具有重要意义。针对类别样本数量不均衡的三分类太阳黑子数据集，提出了双模型集成分类算法。该方法通过一轻一重两个模型，分别承担两个类别的分类任务，再将二者的分类结果进行集成，夹逼出第三个类别的分类结果。实验表明该方法能够减少单个模型在不均衡数据集上出现的过拟合和欠拟合情况带来的不利影响，从新的角度解决了太阳黑子数据集的类别不均衡问题，平均F1分数达到0.931。
分类： 生物学 >> 生物化学 提交时间： 2020-06-15
摘要： 健康人尿液中的蛋白质含量虽较低，但种类却十分丰富，尿蛋白质组所蕴含信息能够展现机体生理与病理早期阶段时的细微差别。蛋白质的化学修饰是指其氨基酸残基或其链末端上参与的共价基团反应，进而使其分子的结构、执行的调控和信息传递的功能得到改变，因此，对尿液蛋白质化学修饰水平的比较与研究同样有重要意义。本研究拟以不同年龄段健康人群的尿液（儿童22例，年轻人10例，老年人6例）为研究对象，通过高分辨串联质谱及非标记定量的蛋白质组学分析方法，结合非限制性修饰鉴定算法整体比较三种类型样品之间的蛋白质化学修饰差异水平。结果表明，涉及多种氨基酸残基的氧化修饰是老年人与青少年尿液蛋白质样品之间的主要差异，且修饰影响了众多蛋白质的生物过程。本研究首次利用非限制性修饰鉴定算法研究了不同年龄段人群的尿液在整体蛋白质组修饰上的差异，并指出了氧化修饰是区分青少年和老年人尿液蛋白质的主要修饰类型。
分类： 生物学 >> 生态学 分类： 地球科学 >> 海洋科学 提交时间： 2017-03-22 合作期刊: 《生态学报》
摘要： 江苏海门蛎岈山牡蛎礁是我国目前现存的面积最大的潮间带活体牡蛎礁，但由于人类活动干扰及泥沙淤积等原因，该自然牡蛎礁面积不断缩小，影响着该牡蛎礁的生态功能与保护管理。于2013-2014年开展了首期江苏海门蛎岈山牡蛎礁恢复工程，基于生态监测结果评估该牡蛎礁恢复工程的生态效果。多层礁体上活体牡蛎丰度显著高于单层礁体（P 0.05）。随着礁体的发育，恢复牡蛎礁上大型底栖动物群落的物种丰度并没有增加，但其平均总密度和总生物量均呈现显著性的增长（P 0.05），但显著高于未恢复区（P < 0.05）；恢复牡蛎礁与自然牡蛎礁具有显著不同的大型底栖动物群落（ANOSIM，P=0.001）。研究结果表明该牡蛎礁恢复工程取得初步成功。
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