基于Ks 分布的被子植物演化的时间尺度研究

分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2022-04-29 合作期刊: 《广西植物》

焦贝贝 王希胤

摘要： 物种演化时间估算是生命演化研究的重要部分。近年来，许多研究发现不同基因和不 同物种的进化速率差异显著，因此需要新的方法对进化事件发生时间进行重新估计。为了对 被子植物演化时间的从新估计，基于共享多倍化事件或共享分歧事件应该有共同 Ks 峰值的 理念，建立了基于基因组数据的进化速率矫正模型，结果如下：（1）对获取 Ks 分布三种 常见的方式进行了比较分析，明确了通过提取共线性区块上 Ks 值的中位数的方式最优。（2） 模拟了 Ks 值随时间累积系数v 的变化过程下的 Ks 分布。当假设v 服从正态分布时，Ks 分 布出现了长尾现象。（3）将矫正方法在被子植物中的应用，发现不同谱系的被子植物具有 同步的辐射进化和适应性进化现象。而且被子植物的进化速率虽然差异显著，但不同分支间 的进化速率仍具有部分一致性。例如，木兰类植物进化速率最慢，真双子叶植物次之，单子 叶植物进化速率最快。最终得到了相对可靠的物种的演化时间轴，为植物研究提供系统发育 和演化的支撑。

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