分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2022-03-18 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 为探索兰科（Orchidaceae）植物毛唇芋兰（Nervilia fordii）根中和根际土壤真菌群落 多样性，本研究采用 Illumina MiSeq 高通量测序技术，分析了大新（DX）和龙州（LZ）两 个样地毛唇芋兰根中和根际土壤的真菌组成。结果表明：（1）两个地区的毛唇芋兰根中和 根际土壤真菌多样性很丰富，根际土壤真菌多样性均高于根中，主根的真菌多样性高于走茎； （2）通过测序总共获得有效序列 118 040 条，207 个可操作分类单元（OTUs）涉及 8 门 19 纲 42 目 86 科 123 属；（3）担子菌门（Basidiomycota）真菌是两地毛唇芋兰根中真菌的共 同优势菌群， 涉及胶膜菌科（ Tulasnellaceae ） 、Trimorphomycetaceae 、角担菌科 （Ceratobasidiaceae）、马拉色菌科（Malasseziaceae）和小皮伞科（Marasmiaceae）等，其 中，优势科和优势属分别是胶膜菌科（75%）和瘤菌根菌属（Epulorhiza）（56%）；然而， 土壤中的优势菌属则是镰刀菌属（Fusarium）。综上结果表明,毛唇芋兰根中菌群与根际土 壤中的优势菌群差异显著，但也存在一些共同的 OTUs；同时，本研究结果也暗示 Epulorhiza 真菌可能对毛唇芋兰种子萌发和种苗生长发育产生至关重要的影响。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-03-24 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 研究牛大力淀粉酶基因家族的生物活性，为牛大力生长发育规律的揭示及根膨大的相关基因的筛选奠定基础。该文基于不膨大和膨大的牛大力根的转录组测序结果，采用生物信息学技术对筛选到的28 个牛大力淀粉酶基因进行分析。28 个牛大力淀粉酶相关蛋白基因编码的氨基酸序列分子量从20.78 KDa到349.39 KDa不等；均为酸性蛋白；亚细胞定位部分在叶绿体；具有PLN02784 super family、AmyAc-family super family结构域；二级结构中除MsAm1, 7, 8, 15, 16, 22, 23, 28中α螺旋占比最大外，无规则卷曲的比例最大；三级结构预测具有α淀粉酶结构、β淀粉酶结构、异淀粉酶结构等；淀粉酶基因家族共有86 个作用元件，MsAm9的作用元件最多（42 个）；系统发育树表明MsAm15,16归于1 类，且均具有motif 2, motif 3, motif 7, MsAm4, 24, 26归于1 类，与拟南芥淀粉酶进行比对，AtBM4和MsAM6归为一类，AtAM2和MsAM2归为一类，AtBM8和MsAM5归为一类，AtBM4和MsAM6归为一类，AtAM10和MsAM22归为一类，AtIM3和MsAM17归为一类。这些分析结果可为今后深入研究28 个牛大力淀粉酶的生物学功能和调控机制提供一定的理论依据，为牛大力根部膨大的研究及品种的改良提供参考。
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