分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-07-20 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 分子系统学研究将传统梧桐科与锦葵科、木棉科和椴树科合并为广义锦葵科，并进一步分为9个亚科。然而，9个亚科之间的关系尚未完全明确，且梧桐亚科内的属间关系也未得到解决。为了明确梧桐亚科在锦葵科中的系统发育位置，厘清梧桐亚科内部属间系统发育关系，该研究对锦葵科8个亚科进行取样，共选取55个样本，基于叶绿体基因组数据，采用最大似然法和贝叶斯分析构建系统发育树。结果表明：（1）广义锦葵科中，刺果藤亚科和扁担杆亚科组成Byttneriina分支，Malvadendrina分支中山芝麻亚科为其他亚科的姐妹群，随后分出梧桐亚科（WCG、LSC和SSC矩阵构成的数据集），以及Malvatheca分支（木棉亚科和锦葵亚科）与非洲芙蓉亚科-椴树亚科的姐妹关系；（2）在梧桐亚科中，可乐果属分支（Cola clade）是独立一支，随后是酒瓶树属分支（Brachychiton clade）与苹婆属（Sterculia clade）+ 银叶树属分支（Heritiera clade）形成姐妹关系（WCG、LSC和CDS矩阵）；（3）在可乐果属分支（Cola clade）中，可乐果属等为梧桐属（含闭果桐属）和胖大海属+舟翅桐属的姐妹群。该研究基于叶绿基因组数据基本澄清了广义锦葵科的亚科系统关系以及梧桐亚科内各属关系，系统发育树框架基本明晰，但梧桐亚科在Malvadendrina分支的位置和酒瓶树属在梧桐亚科的位置，以及梧桐属的概念及范围仍需进一步研究，尤其是结合核基因组数据进行分析。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2021-07-20 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 旋花科是一个世界广布的热带类群，具有丰富的形态特征和重要的经济价值。然而，目前该科主要分支或族间的系统发育关系一直未解决。为解析旋花科内系统发育关系，该研究代表性取样旋花科内 8 个族 40 个物种，基于质体全基因组数据，使用最大似然法和贝叶斯推论进行系统发育分析。结果表明：（1）旋花科质体基因组均为四分体结构，基因组大小为 113 273~164 112 bp，蛋白质编码基因数目为 66~79 个。（2）基于五种 DNA 矩阵（即 WCG、 CDS、LSC、IR、SSC）的系统发育分析结果显示，WCG 和 CDS 矩阵的拓扑结构基本一致，仅少数分支的支持率略有差异；LSC 区和 WCG 矩阵的拓扑结构差异在于菟丝子族、马蹄金族和盐帚花族的系统位置；AU 和 SH 检验表明 WCG 矩阵和 SSC 与 IR 区矩阵的拓扑结构有显著冲突。（3）所有系统发育分析结果均显示，菟丝子属和马蹄金族都包括在旋花亚科内，应处理为族等级。（4）基于 WCG 和 CDS 矩阵较好地解决了旋花科 8 个族之间的系统发育关系，即心被藤族和丁公藤族聚为一支，最先从旋花亚科分化出来，随后是菟丝子族，剩下 的五个族分成两个分支。（5）系统发育基因组分析证实鱼黄草族是一个多系类群，特别是鱼黄草属，因此需重新修订该族的分类地位和鱼黄草属的划分。
分类： 生物学 >> 植物学 >> 应用植物学 提交时间： 2020-08-02 合作期刊: 《广西植物》
摘要： 印度血桐与中平树是大戟科血桐属植物，该属植物具有多种药用价值，被广泛应用于民间医学中许多疾病的治疗，这两种植物种子中含有的神经酸也引起了研究者的高度关注。为确定适合印度血桐与中平树的全基因组测序研究策略。本实验采用二代高通量测序技术，结合生物信息学的方法首次测定了印度血桐与中平树的基因组大小、杂合率、重复率等基因组信息；初步分析了两种材料的
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