分类: 计算机科学 >> 计算机应用技术 提交时间: 2017-03-09
摘要: 蛋白质鉴定是蛋白质组学研究的基础问题,而利用串联质谱搜索蛋白质序列数据库是目前蛋白质鉴定最成功和最常用的方法。蛋白质鉴定软件本质上是一个信息检索系统,具有检索系统的共性,但与文本或多媒体检索相比,又有其非常特殊之处,比如对检索结果进行可靠性评估是蛋白质鉴定必不可少的一步,而这对于其它检索问题往往是不需要的。本文综述蛋白质鉴定搜索引擎中的关键计算问题及其研究进展,包括数据库搜索匹配打分、鉴定结果可靠性统计评估、蛋白质修饰鉴定等,并对我们自己研制的蛋白质鉴定搜索引擎pFind 做简要介绍。