分类： 其他 >> 综合 提交时间： 2023-03-19 合作期刊: 《中国科学院院刊》
摘要： 生物医学数据从PB量级的组学时代进入到EB量级的多维度大数据时代，引发了生物医学研究向数据密集型的第四科学范式的深刻变革。如何将临床数据与研究数据进行高维度多层次的汇交共享，实现从“组学”到临床与健康人群数据的生物医学大数据的综合管理利用，从而使大数据迅速转化为新知识，成为生物医学大数据所面临的挑战。发展以递交为基础、以整合为导向的数据存储技术，以主题为基础、以交互为导向的数据共享技术，以及以传统信息技术为基础、以前沿信息技术为导向的数据分析挖掘技术，并同时开展标准质控相关研究，是生物医学大数据存储、共享和转化的新思路，也是构建新一代生物医学大数据研究中心的技术关键和未来趋势。
分类： 其他 >> 综合 提交时间： 2017-03-22 合作期刊: 《中国科学院院刊》
摘要： 宏基因组研究的思想与技术推动了微生物组的兴起，积累了丰富的微生物基因组以及健康、动植物和环境相关的微生物宏基因组数据，形成了具备一定规模和影响力的数据库、标准化方法与分析工具。大多数平台聚焦于为项目或特定类型的微生物菌群提供数据支撑，难以满足更深入全面的微生物生物学研究需求。文章建议采用综合聚焦微生物分类单元总和的微生物系统组与聚焦特定生态位微生物种群总和的微生物组的思路，建设综合性的微生物组数据仓库，整合微生物分类、进化、生态以及相关“组学”数据与信息。在此基础上，进一步综合生命科学基础研究和系统合成生物学研究的数据，支撑经高水平质控的综合性参考数据库、标准化的拼接与注释以及一流的数据汇交、搜索分享、深度学习和分析挖掘方法的研究开发。由此，亦将进一步集成大型微生物组项目的元数据及数据，形成数据综合完整、管理安全高效，服务功能完备的微生物组大数据中心。
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