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1. chinaXiv:202002.00004 [pdf]

武汉2019冠状病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点

李鑫; 段广有; 张伟; 施劲松; 陈嘉源; 陈舜梅; 高山; 阮吉寿
Subjects: Biology >> Virology

摘要:2019年12月,中国武汉报道了Beta冠状病毒引起的肺炎。基于基因组信息,溯源分析的结果支持武汉2019冠状病毒源自中华菊头蝠,但与SARS冠状病毒差异很大,这一结果与两者临床症状差异一致。前期研究还发现了Beta冠状病毒存在大量的可变翻译,并从分子水平揭示了该病毒变异快、多样性高的特点。本研究在国际上首次报道一个重要的变异,这个变异引入了一个可供Furin蛋白酶切的位点,是此前所有发现的SARS和SARS样(SARS-like)冠状病毒所不具备的,这种变异有可能增强了武汉2019冠状病毒的传播能力。作为一个意外发现,一些禽流感病毒也可以通过突变获得一个Furin蛋白酶切位点,以提高其侵染细胞的效率。2019冠状病毒的包装机制有可能与鼠肝炎冠状病毒、HIV、埃博拉病毒和一些禽流感病毒的包装机制相同,而不同于SARS等其它大部分Beta冠状病毒。本研究的思路和方法对研究病毒变异,以及药物、抗体和疫苗的开发等依然有指导意义。如果Furin蛋白酶切位点及相关机制预测正确,意味着现有的大量抗病毒药物(特别是Furin蛋白酶抑制剂)可以利用,实现老药新用。另外,我们从临床治疗心衰的组合用药数据中为武汉肺炎的鸡尾酒疗法推荐了几种可以抑制Furin蛋白酶的药物。

submitted time 2020-02-02 Hits37155Downloads11012 Comment 0

2. chinaXiv:201605.00569 [pdf]

迁移学习研究进展

庄福振; 何清
Subjects: Computer Science >> Computer Application Technology

近年来,迁移学习已经引起了广泛的关注。迁移学习是运用已存有的知识对不同但相关领域问题进行求解的新的一种机器学习方法。传统机器学习基于两个基本假设:(1) 用于学习的训练样本与新的测试样本满足独立同分布的条件;(2) 必须有足够可利用的训练样本才能学习得到一个好的分类模型。迁移学习降低了要求,目的是迁移已有的知识来解决目标领域中仅有少量或没有有标签样本数据时的学习问题。本文对迁移学习算法以及相关理论研究进展进行了综述,并介绍了我们在该领域所做的研究工作,特别是利用生成模型在概念层面建立迁移学习模型。最后指出了迁移学习下一步可能的研究方向。

submitted time 2016-05-03 Hits33214Downloads8488 Comment 0

4. chinaXiv:201603.00031 [pdf]

我国科研人员对arXiv认知和使用的现状调查与分析

张智雄; 张闪闪; 顾立平; 李麟
Subjects: Library Science,Information Science >> Library Science

【目的】了解中国用户对 arXiv预印本平台的认知、使用情况以及对 arXiv发展的意见建议。【方法】基于国内 9家高校及科研机构的教师、研究人员和研究生群体的问卷调查,作者获得 510份调查数据,并运用 SPSS等分析工具对调查数据进行分析。【结果】结果表明,我国科研人员对 arXiv的认知程度还不是很高,但熟悉 arXiv的国内科研人员已认识到在 arXiv上发布论文是占据成果首发权和征求同行意见的重要手段。【局限】在调查取样上仅限于中国 arXiv服务工作组的成员单位,非成员单位的 arXiv用户没有纳入。【结论】为了让 arXiv能够更多地惠及我国科研,中国 arXiv服务工作组需要采取更为积极的行动,加快推动 arXiv在国内更广泛深入的应用。

submitted time 2016-03-14 Hits34709Downloads6482 Comment 0

5. chinaXiv:201605.00570 [pdf]

深度学习概述

常虹; 山世光
Subjects: Computer Science >> Computer Application Technology

深度学习是机器学习领域的一个新的研究方向,其核心思想在于模拟人脑的层级抽象结构,通过无监 督的方式从大规模数据(例如图像、声音和文本)中学习特征。近年来,深度学习在计算机视觉、语音识 别等研究领域取得的巨大成功使得研究者们对其寄予更多的关注。本文从深度学习的概念、发展历程、模 型、训练方法以及应用等几个方面对其进行概述,并对深度学习的未来发展做出展望。

submitted time 2016-05-03 Hits32926Downloads6382 Comment 1

6. chinaXiv:201709.00120 [pdf]

贝叶斯因子及其在JASP中的实现

胡传鹏; 孔祥祯; Eric-Jan Wagenmakers; Alexander Ly; 彭凯平
Subjects: Psychology >> Statistics in Psychology

统计推断在科学研究中起到关键作用,然而当前科研中最常用的经典统计方法——零假设检验(Null hypothesis significance test, NHST)却因难以理解而被部分研究者误用或滥用。有研究者提出使用贝叶斯因子(Bayes factor)作为一种替代和(或)补充的统计方法。贝叶斯因子是贝叶斯统计中用来进行模型比较和假设检验的重要方法,其可以解读为对零假设H0或者备择假设H1的支持程度。其与NHST相比有如下优势:同时考虑H0和H1并可以用来支持H0、不“严重”地倾向于反对H0、可以监控证据强度的变化以及不受抽样计划的影响。目前,贝叶斯因子能够很便捷地通过开放的统计软件JASP实现,本文以贝叶斯t检验进行示范。贝叶斯因子的使用对心理学研究者来说具有重要的意义,但使用时需要注意先验分布选择的合理性以及保持数据分析过程的透明与公开。

submitted time 2018-05-08 Hits50985Downloads6128 Comment 0

7. chinaXiv:202002.00004 [pdf]

武汉2019冠状病毒S蛋白可能存在Furin蛋白酶切位点

李鑫; 段广有; 张伟; 施劲松; 陈嘉源; 陈舜梅; 高山; 阮吉寿
Subjects: Biology >> Virology

摘要:2019年12月,中国武汉报道了2019新型冠状病毒(2019 novel Coronavirus,2019-nCoV)引起的肺炎。基于基因组信息,我们前期研究结果显示2019-nCoV与SARS冠状病毒虽然同属于Beta冠状病毒B亚群(BB冠状病毒),但两种病毒差异很大,这一结果与两者临床症状差异一致。前期研究还发现了BB冠状病毒存在大量的可变翻译,并从分子水平揭示了BB冠状病毒变异快、多样性高的特点。本研究在国际上首次报道BB冠状病毒S蛋白上的一个重要突变,这个突变使2019-nCoV具有了一个可供Furin蛋白酶切的位点,是除鼠肝炎冠状病毒外所有的其它BB冠状病毒(包括SARS和SARS样(SARS-like)冠状病毒)所不具有的。这个突变有可能增强了2019-nCoV侵染细胞的效率,进而使其传播力显著大于SARS冠状病毒。由于这个突变,2019冠状病毒的包装机制也会不同于SARS等其它大部分Beta冠状病毒,而有可能与鼠肝炎冠状病毒、HIV、埃博拉病毒和一些禽流感病毒的包装机制相同。作为一个意外发现,一些禽流感病毒也可以通过突变获得Furin蛋白酶切位点。对这个重要突变的后续研究将为揭示2019-nCoV传播力强的原因,以及为药物、抗体和疫苗的开发等工作奠定基础。

submitted time 2020-02-14 Hits33122Downloads4747 Comment 0

8. chinaXiv:201703.00035 [pdf]

2017年国际原油市场走势分析与价格预测

姬强,刘炳越,赵万里,马嫣然,范英
Subjects: Energy Science >> Energy Science (General)

2017年,OPEC和非OPEC国家减产协议的执行力度将是影响国际石油价格走势的最大变数。国际石油市场供需两侧均面临很大的不确定性,美国页岩油产量的恢复速度、OECD国家石油需求的反弹力度以及新兴经济体对石油需求的拉动作用都将影响石油市场的再平衡状态。除此之外,美国加息的不确定性、市场投机的活跃程度以及地缘政治的“黑天鹅”事件都将增加油价的短期波动性。文章通过自主研发的油价综合分析预测系统预测,2017年国际油价将保持窄幅震荡,Brent年平均油价为56美元/桶,WTI年平均油价为55美元/桶,平均价差保持在1美元/桶左右。

submitted time 2017-03-08 From cooperative journals:《中国科学院院刊》 Hits11124Downloads4723 Comment 0

9. chinaXiv:201708.00369 [pdf]

基于卷积神经网络的轴承故障定性诊断

单建华; 吕钦; 张神林
Subjects: Mechanical Engineering >> Other Disciplines of Mechanical Engineering

轴承定性诊断的传统方法需要复杂难懂的数学知识和高深的领域知识;基于深度置信网络的方法虽然克服了传统方法的缺点,但网络参数规模巨大,训练困难;基于时频图的卷积神经网络方法需用小波变换得到时频图。由于卷积神经网络具有强大的特征学习能力和泛化能力,提出了一种基于卷积神经网络的轴承故障定性诊断方法,直接利用一维振动信号对卷积神经网络进行训练。优势在于克服了传统方法的缺点;相比深度置信网络,网络参数少很多,训练高效;也无需小波变换得到时频图。采用西储大学和本实验室轴承数据,进行了一系列全面测试,表明本文方法能准确地定性诊断轴承故障,准确率高于其他所有方法;首次通过利用西储大学的轴承数据训练的卷积神经网络准确诊断了本实验室待测轴承的故障类型,这表明该方法能实际工程运用。

submitted time 2017-08-29 Hits6435Downloads3942 Comment 0

10. chinaXiv:201703.00162 [pdf]

实体及其属性的相关抽取技术

孟涛; 曹雷; 折闪电; 程学旗
Subjects: Computer Science >> Computer Application Technology

信息抽取是当前搜索引擎与自然语言处理研究领域的核心技术之一,它用来对文本做匹配,以获得其中包含的各种实体以及它们的属性及关系。本文对实体及其属性的抽取做了简单介绍,包括基于规则的抽取技术和基于统计的抽取技术,并介绍了几个典型的系统实例,如:IE2、GATE和SystemT及它们的原理,最后简单介绍了我们在这个领域的工作成果。

submitted time 2017-03-09 Hits5461Downloads3838 Comment 0

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