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1. chinaXiv:201703.00221 [pdf]

电子断层三维重构技术的研究与进展

张法; 万晓华; 储琪
分类: 计算机科学 >> 计算机科学的集成理论

电子断层三维重构技术能够在纳米尺度下重构出不具有全同性的细胞或大分子的三维结构,已经成为一种公认的研究生物大分子结构强有力手段。然而,电子断层三维重构仍然存在二维图像对位不精确、重构算法精度低和重构速度极其缓慢等问题。针对以上问题,本文详细介绍了电子断层三维重构的发展和 现状,分析了当前所面临的主要挑战问题,着重介绍了我们在电子断层三维重构相关研究工作上的进展。

提交时间: 2017-03-10 点击量3118下载量1153 评论 0

2. chinaXiv:201703.00176 [pdf]

复杂生物网络及非编码RNA参与的双色网络

刘长宁; 孙世伟; 赵屹; 卜东波
分类: 计算机科学 >> 计算机应用技术

非编码核糖核酸(noncoding RNA, ncRNA)和复杂生物网络是目前生物学研究,特别是基因组研究领域快速发展的两个方向,也是生物信息学研究所关注的热点。本文分别对非编码核糖核酸研究以及复杂生物网络研究的相关背景和最新研究进展,特别是生物信息学在其中的应用进行了介绍,并进一步讨论了将非编码核糖核酸引入复杂生物网络研究的重要意义以及下一步的可能工作方向。

提交时间: 2017-03-09 点击量489下载量405 评论 0

3. chinaXiv:201703.00167 [pdf]

串联质谱蛋白质鉴定的关键计算问题

付岩; 贺思敏; 孙瑞祥; 王乐珩
分类: 计算机科学 >> 计算机应用技术

蛋白质鉴定是蛋白质组学研究的基础问题,而利用串联质谱搜索蛋白质序列数据库是目前蛋白质鉴定最成功和最常用的方法。蛋白质鉴定软件本质上是一个信息检索系统,具有检索系统的共性,但与文本或多媒体检索相比,又有其非常特殊之处,比如对检索结果进行可靠性评估是蛋白质鉴定必不可少的一步,而这对于其它检索问题往往是不需要的。本文综述蛋白质鉴定搜索引擎中的关键计算问题及其研究进展,包括数据库搜索匹配打分、鉴定结果可靠性统计评估、蛋白质修饰鉴定等,并对我们自己研制的蛋白质鉴定搜索引擎pFind 做简要介绍。

提交时间: 2017-03-09 点击量462下载量418 评论 0

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