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1. chinaXiv:201812.00200 [pdf]

聚合酶链式反应-变性梯度凝胶电泳技术分析1只死亡野生川金丝猴胃肠道菌群多样性

曾燕; 牛李丽; 邓家波; 王强; 余建秋; 李杨; 周梦佳; 徐帅; 林奕岑; 曾东; 倪学勤
分类: 生物学 >> 动物学

本试验旨在对1只死亡野生川金丝猴的胃肠道菌群多样性及其克隆测序条带的系统进化树进行分析。取死亡野生川金丝猴胃肠道内容物,进行聚合酶链式反应(PCR)-变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析,结合条带的克隆测序、聚类分析和主成分(PCA)分析检测菌群多样性并构建系统进化树。结果显示:1)野生川金丝猴整个胃肠道栖息着大量细菌,且来自胃、小肠的样品聚为一大簇,来自大肠的样品聚为一簇,而来自粪便的样品单独聚为一簇。2)从DGGE图谱上共回收18个条带,细菌种类鉴定主要是5个菌门,分别为变形菌门(Proteobacteria,38.89%)、厚壁菌门(Firmicutes,22.22%)、拟杆菌门(Bacteroidetes,5.56%)、放线菌门(Actinobacteria,5.56%)、疣微菌门(Verrucomicrobia,5.56%)和不可培养菌(uncultured bacterium,22.22%)。其中,变形菌门和厚壁菌门分布于整个胃肠道。3)菌群的系统进化树分析表明,仅有1种不可培养菌与已鉴定的粪肠球菌进化分类相似,而其他不可培养菌与已知的菌种进化分支差异较大,说明在野生川金丝猴的胃肠道中仍有大量的菌群信息未被鉴定。结果提示,本试验测定的1只死亡野生川金丝猴的胃肠道优势菌群为变形菌门,菌群多样性随着胃肠道由前至后的顺序呈现高-低-高的趋势。

提交时间: 2018-12-20 来自合作期刊:《动物营养学报》 点击量42下载量29 评论 0

2. chinaXiv:201711.01415 [pdf]

基于高通量测定肉鸡回肠微生物多样性及PICRUSt基因预测分析

徐帅; 林奕岑; 周梦佳; 倪学勤; 曾东; 曾燕
分类: 生物学 >> 动物学

本试验旨在研究健康肉鸡回肠的微生物群落结构及功能。采用高通量测序技术对15只鸡的回肠内容物进行测序,按照97%的相似度归类OTUs,去除序列数量少的OTUs(n<2),然后进行生物信息学分析及PICRUSt基因预测。结果表明:1)共获得424 062条tags,并归类于1 002个非单OTUs,样品平均tags为(28 271±8 855)条,平均OTUs为(261±82)个。2)所有样品共含有20个菌门,160个菌属。其中,共享核心菌门4个,分别是厚壁菌门(85.35%)、变形菌门(6.09%)、蓝细菌门(2.15%)和放线菌门(0.16%)。共享核心菌属19个,占样品总微生物总量的93.75%。3)鸡回肠预测得出328个功能。从前20功能热图可知,各样品的效能存在差异。由此可见,鸡回肠微生物群落复杂,但主要菌群相对稳定。本试验为进一步研究鸡回肠微生物群落结构与功能提供参考依据。

提交时间: 2017-10-11 来自合作期刊:《动物营养学报》 点击量167下载量108 评论 0

3. chinaXiv:201606.00054 [pdf]

从SCOAP3模式看图书馆资源建设的范式转变

张晓林; 李麟; 顾立平; 曾燕
分类: 图书馆学、情报学 >> 图书馆学

介绍SCOAP3资助联盟将高能物理学术论文转为开放出版的基本模式、内容范围和运行机制,指出它所代表的开放出版资助方式更适合数字网络时代,能更有效、更经济地保障知识获取,强调这种模式同样服务于图书馆保障信息获取的本质目标,并为图书馆扩展信息服务、提高自身地位和作用提供新的空间。

提交时间: 2016-06-08 点击量220下载量124 评论 0

4. chinaXiv:201606.00046 [pdf]

开放获取期刊的评价与遴选:质量水平、开放程度和服务能力

顾立平; 张晓林 ; 初景利; 李麟; 曾燕
分类: 图书馆学、情报学 >> 图书馆学

提出在源生数字、源生开放的影响下,开放获取期刊发展的新需求和新方向,据此重新界定开放获取期刊应该具有的新能力和新服务,为此重新定义包括期刊质量与影响水平、期刊开放程度和期刊服务能力等方面的评价指标集。

提交时间: 2016-06-08 点击量855下载量678 评论 0

5. chinaXiv:201606.00041 [pdf]

研究图书馆推进开放获取的战略与实践—以国家科学图书馆为例

张晓林; 刘细文; 李麟; 曾燕; 顾立平
分类: 图书馆学、情报学 >> 图书馆学

从国家科学图书馆(简称“国科图”)作为中国科学院China OA Officer和科技信息开放获取的关键推动者的角度,运用多维结构法提出了国科图开放获取战略框架,介绍国科图开放获取实践,包括协助中国科学院建立开放获取战略、组织开放获取研究和知识传播、建设中国科学院机构知识库网络、支持中国科学院作者发表开放论文等。

提交时间: 2016-06-07 点击量556下载量133 评论 0

6. chinaXiv:201606.00023 [pdf]

英国科技报告制度调研与分析—支持科技报告存储与传播的政策环境

吴蓉; 顾立平; 曾燕
分类: 图书馆学、情报学 >> 图书馆学

[目的/意义]图书馆是实施科技报告存储与传播的核心推进力量,为探索良好实践的实施细节,调摘要:[目的/意义]图书馆是实施科技报告存储与传播的核心推进力量,为探索良好实践的实施细节,调查国外科技报告的相关管理措施。[方法/过程]调研分析英国的法律法规以及科研资助机构、科研教育机构的相关政策,以文献综述的方法梳理政策要素。[结果/结论]调查结果显示,有效推进科技报告存储与传播的政策环境,包括以下要素:保障贡献者的署名权和财产权,实现公众的知情权和使用权,落实资助者要求存储与共享的在先权利和审查权利,明确管理者的角色定位与问责机制等。图书馆在实施过程中应注意各方利益关系人的权益平衡。

提交时间: 2016-06-04 点击量154下载量105 评论 0

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