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多刺绿绒蒿 WD40 基因家族的鉴定及生物信息学分析

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WD40 转录因子家族广泛参与调节植物生长、发育、次生代谢物积累和环境适应等过程。为了探究?WD40 家族在多刺绿绒蒿生长、发育和次生代谢物积累以及抗逆方面的作用,本研究基于多刺绿绒蒿全长转录组测序数据,鉴定了所有?WD40 基因,并对这些基因及其编码的蛋白进行了生物信息学分析。结果表明:共鉴定到?19 个?WD40 基因,编码的蛋白均具有?WD40 结构域,氨基酸数目?109~758 aa,分子量为11 830~84 130 Da,预测大多数蛋白定位在细胞核中且都为亲水性蛋白;系统进化树分析表明多刺绿绒蒿与罂粟、博落回亲缘关系较近;WD40 基因启动子区域均存在数量不等的激素或逆境响应元件,表明该家族基因可能参与生长、发育和次生代谢物积累等多种生物学进程的调节;蛋白三级结构显示这些蛋白在进化过程中发生了不同程度的进化。这些结果可为深入研究多刺绿绒蒿?WD40 基因家族在其响应逆境胁迫和次生代谢物积累等方面的具体机制提供前期基础。
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Recommended references: 任玉玲,赵艳,赵成周,李萍.(2021).多刺绿绒蒿 WD40 基因家族的鉴定及生物信息学分析.广西植物.[ChinaXiv:202112.00021] (Click&Copy)
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[V1] 2021-11-04 22:13:26 chinaXiv:202112.00021V1 Download
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